靶标鉴定Target Identification是现代药物研发的重要组成部分也是阐明药物作用机制的关键步骤。近年来非标记Label-free技术因无需对药物进行探针修饰能够保持分子的天然活性而得到广泛应用。DARTS药物亲和响应靶标稳定性与LiP-MS有限蛋白水解质谱作为两种典型的非标记靶点鉴定技术在实验原理、检测方式及应用领域方面各具特点。DARTS技术主要利用药物与蛋白结合后的保护作用完成靶标筛选。当天然产物单体、中药复方提取物或其他活性小分子与蛋白结合后目标蛋白对蛋白酶的降解抵抗能力增强因此能够在酶解后保留下来。实验一般采用SDS-PAGE分离蛋白再结合质谱MS进行鉴定。由于跑胶步骤能够减少非特异性肽段进入检测体系因此实验背景较低数据稳定性较好同时整体实验流程成熟成本相对较低。LiP-MS则从蛋白构象变化角度开展分析。药物结合蛋白后会改变蛋白空间构象、稳定性及位阻使部分酶切位点受到遮挡。实验首先利用非特异性蛋白酶如PK酶进行有限水解再使用胰酶进行完全水解最终通过质谱分析不同肽段变化情况。相比DARTSLiP-MS能够获得更加细致的蛋白结构变化信息但实验流程更加复杂。在复杂样本研究中LiP-MS仍存在一定局限。有限水解和完全水解产生的大量肽段共同进入分析体系使数据处理更加复杂在单一药物剂量条件下较难区分真实靶点与假阳性。同时高丰度蛋白更容易被质谱优先识别而低丰度调控蛋白容易受到掩盖因此真正药物靶点的检出率相对较低。目前该技术更适用于大肠杆菌等复杂度较低的生物体系以及简单代谢物研究。DARTS则具有更加广泛的适用范围。该技术能够在细胞裂解液中模拟药物天然结合环境适用于细胞、组织以及菌类等不同样本类型。对于天然产物和中药复方研究而言DARTS凭借成熟稳定的实验流程、较高的可靠性以及较低的假阴性风险依然是当前非标记靶点初筛的重要技术选择。达吉特DARTS技术服务文献部分客户文献[1]. Zhou J, Song Q, Li H, et al. Targeting circ-0034880-enriched tumor extracellular vesicles to impede SPP1highCD206 pro-tumor macrophages mediated pre-metastatic niche formation in colorectal cancer liver metastasis. Mol Cancer. 2024;23(1):168. Published 2024 Aug 20. doi:10.1186/s12943-024-02086-9.(上海中医药大学附属曙光医院) IF27.7[2]. Zhang W, Song Y, Li C, et al. Canagliflozin Alleviates Diabetic Glomerular Endothelial Injury via Melibiose in a Microbiota-Dependent Manner. Adv Sci (Weinh). Published online May 27, 2026. doi:10.1002/advs.202517222.郑州大学第一附属医院IF14.1[3]. Yang X, Lin G, Chen Y, et al. Chlorquinaldol Alleviates Lung Fibrosis in Mice by Inhibiting Fibroblast Activation through Targeting Methionine Synthase Reductase. ACS Cent Sci. 2024;10(9):1789-1802. Published 2024 Aug 28. doi:10.1021/acscentsci.4c00798.广州医科大学IF12.7[4]. Liang Y, Zhang YL, Cheng TY, et al. Senkyunolide H potentiates bone marrow-derived mesenchymal stem cells therapy for liver cirrhosis by targeting MAEA to enhance ERK-driven HGF secretion. Pharmacol Res. 2026;226:108160. doi:10.1016/j.phrs.2026.108160.上海中医药大学IF10.5[5]. Zhao R, Lu Y, Xu Q, et al. Gut blautia coccoides-derived 5Z-dodecenoic acid attenuates chronic psychological stress-induced gastric cancer progression. Int J Surg. Published online November 20, 2025. doi:10.1097/JS9.0000000000004080.(中国人民解放军总医院第一医学中心) IF10.3[6]. Zhang S, Tang L, Pu Y, et al. Patchouli alcohol triggers autophagic cell death in non-small cell lung cancer cells through targeting GNAI1 to dissociate the GNAI1/ARRB1 complex. Int J Biol Sci. 2026;22(8):4004-4024. Published 2026 Mar 30. doi:10.7150/ijbs.125690.中国上海市宝山区吴淞中心医院IF10.0
